《山海经》灵芝神话起源于《山海经》。《山海经中次七经》说，炎帝小女名“瑶姬”，刚到出嫁之年，即“未行而卒”。她的精魂飘荡到“姑瑶之山”，“化为瑶草”，“实为灵芝”，“其叶胥茂，其华黄”。因“天帝”（炎帝）哀怜瑶姬早逝，便封她做巫山云雨之神。有一天，楚怀王来到云梦，住进一所叫“高唐”的台馆，这位渴慕爱情的女神悄然走进寝宫，向正在午睡的楚怀王倾诉情爱，楚怀王从朦胧中醒来，记起她在梦中临别时的叮嘱：“妾在巫山之阳，高邱之，旦为朝云，暮为行雨，朝朝暮暮，阳台之下。”便给瑶姬立了一座庙，叫作“朝云”。后来，楚怀王的儿子楚襄王来这里游玩，也做了一个同样的梦。楚国著名诗人宋玉根据这两个梦，写成传颂千古的《高唐赋》和《神女赋》。现在，巫山生长灵芝特别多，传说都是女神洒下的相思子。

《洛神赋》三国著名诗人曹植的代表作“洛神赋”，是一个描写人神恋爱的故事，其中有“尔乃税驾乎蘅，秣驷乎芝田”，意思是你驾着华丽的马车到蘅出游，晚来将驾车的马驱赶到栽种芝草的田野上放牧。汉班固《汉武帝内传》是六朝人伪托，着重写汉武帝与西王母故事，也谈到西王母居住的昆仑山上种有芝田。这是有关灵芝神话传说的又一个系统。由此派生出另一个神话故事：旧俗三月三日为西王母寿诞，每到这一天，仙女麻姑都要到绛珠河畔采集灵芝，酿酒为王母祝寿，这段故事已成为河北杨柳青民间年画“麻姑献寿图”的主题。

《白蛇传》是我国家喻户晓的神话故事。白娘子和小青是修炼成仙的蛇精，和尚法海认为二人是蛇妖，百般破坏白娘子和许仙婚姻。白娘子为救夫君，不顾身怀六甲，只身前往峨眉山盗仙草，仙长怜其救夫心切，赠与仙草，救活了许仙。白娘子所盗仙草，即为灵芝。明陈六龙以此故事为题材作《雷锋记》传奇，未见流传；清黄图秘、方成培亦作有《雷锋塔》传奇，另《警世通言》有《白娘子永镇雷锋塔》，弹词有《义妖传》（亦名《白蛇传》），均以白蛇故事为题材创作而成。